| 2000/01 | 4ème de D1. |
| 2001/02 | 6ème de D1. Victoire en finale de Coupe de la Ligue contre le FC Lorient (3-0). |
| 2002/03 | 4ème de Ligue 1. |
| 2003/04 | 12ème de L1. |
| 2004/05 | 15ème de L1. |
| 2005/06 | Vice-champion de France de L1 derrière l'Olympique Lyonnais. |
| 2006/07 | 6ème de L1. Victoire en finale de Coupe de la Ligue contre l'Olympique Lyonnais (1-0). |
| 2007/08 | Vice-champion de France de L1 derrière l'Olympique Lyonnais. |
| 2008/09 | Champion de France de L1. Les 24 joueurs alignés par l'entraîneur Laurent Blanc sont: David Bellion (27m/4b), Fernando Cavenaghi (29m/13b), Mathieu Chalmé (32m/1b), Marouane Chamakh (34m/13b), Alou Diarra (35m/2b), Souleymane Diawara (35m/2b), Pierre Ducasse (8m), Yoan Gouffran (32m/2b), Yoann Gourcuff (37m/12b), Carlos Henrique (16m/1b), Franck Jurietti (18m), Ferreira Jussié (20m/2b), Fernando Menegazzo (31m/6b), Gabriel Obertan (11m), Kévin Olimpa (1m), Diego Placente (6m), Marc Planus (28m/1b), Ulrich Ramé (26m), Henri Saivet (1m), Grégory Sertic (6m/1b), Abdou Traoré (13m), Benoît Trémoulinas (26m), Matthieu Valverde (15m), Geraldo Wendel (29m/4b). Victoire en finale de Coupe de la Ligue contre Vannes (4-0). |
| 2009/10 | 6ème de L1. Défaite en finale de Coupe de la Ligue contre l'Olympique Marseille (1-3). |
| 2010/11 | 7ème de L1. |
| 2011/12 | 5ème de L1. |
| 2012/13 | L1. |